SAAT menerapkan sistem penyuluhan dan pembinaan mahasiswa melalui perwalian kelas untuk urusan yang berkenan dengan hal-hal akademis, dan tutorial untuk hal-hal yang berkaitan dengan kehidupan dan karakter mahasiswa.
Selama belajar di SAAT setiap mahasiswa akan memiliki sebuah kelompok tutorial yang terdiri dari 6-10 mahasiswa dan dibimbing oleh seorang staf dosen, sebagai gembalanya. Melalui kelompok tutorial, keakaraban dan kedekatan staf, dosen, dan mahasiswa diharapkan lebih meningkat, kebutuhan-kebutuhan mahasiswa dapat terperhatikan dan pertumbuhan kerohanian terakomodir.
Setiap mahasiswa yang tidak memiliki asuransi kesehatan, diwajibkan untuk memiliki Asuransi Kesehatan (ASKES) yang dikelola oleh SAAT melalui Klinik Rawat Jalan “Sumber Trisno” yang lokasinya bersebelahan dengan kampus SAAT. Dengan membayar premi bulanan yang terjangkau, mahasiswa bila sakit akan mendapatkan perawatan kesehatan yang memadai.
Meskipun dana yang tersedia terbatas, pihak STT SAAT juga memberikan beasiswa bagi mahasiswa program Sarjana Teologi (S.Th.) dan Magister Divinitas (M.Div.) yang membutuhkan. Mereka yang mengalami kesulitan biaya dapat mengajukan permohonan kepada Kepala Bagian Beasiswa. Beasiswa ini tidak berlaku bagi mahasiswa tahun pertama dan tahun kedua
Adanya soft skills & mastering berdasarkan kebutuhan mahasiswa sesuai dengan visi & misi STT SAAT