Untuk mencapai visi dan misi di atas, Program Sarjana Teologi STT SAAT menetapkan tujuan pendidikan sebagai berikut:
- menghasilkan rohaniwan Kristen sebagai pemimpin rohani yang memiliki sikap, karakter dan perilaku yang meneladani Tuhan Yesus Kristus (Christ-Centered Servant Leader);
- menghasilkan rohaniwan Kristen yang menjalani kehidupan dan pelayanannya berdasarkan pada otoritas Alkitab sebagai firman Tuhan;
- menghasilkan rohaniwan Kristen yang mampu mengintegrasikan aspek akademis, kerohanian, karakter, dan keterampilan dalam bidang pelayanan yang ditekuninya; dan
- menghasilkan rohaniwan Kristen yang mampu melayani di gereja, sekolah, atau lembaga pelayanan lainnya di tengah masyarakat.