神学硕士课程的愿景为成为以圣经为基础，以基督为中心的神学教育指标，并使用整合型，情境化及使命导向的方法。

东南亚圣道神学院神学硕士课程的使命为：

1. 实施以圣经为基础的神学的教育过程，强调在认知知识、基督教品格及实际服侍能力之间的平衡。
2. 进行文献和/或实证研究，用以丰富神学知识库，使其能应用于教会、学校或其他机构的复试中；并
3. 实施社会服务项目，以教学、培训和辅导的形式为教会成员、学校及社区提供服务

为实现以上愿景及使命，东南亚圣道神学院神学硕士课程已设立一下教育目标：

1. 培养能够学校发基督的态度、品格及行为的基督教神职人员；
2. 培养将神的权柄作为生活及事工的基础的神职人员；
3. 培养能够在教会、学校或社区其他服务机构服务的基督教神职人员。以及：
4. 培养能够独立和创造性地开展研究，促进学术界发展和/或基督教服事的基督教神职人员。

神学硕士课程的学业负担为45个学分，具体分配如下：

• 13门课程，各3学分（总计39学分）
  [该13门课程含5门基础课程、6门专修课程及2门选修课程。]
• 论文写作（6学分）

本课程学制为2年，最长期限为4年。

神学硕士课程的教学模式（心理辅导专修除外）将采用O&O（线上与线下结合模式）模式，同时采用线上教学与面授课程。具体安排为：

• 10门课程以线上会议常规课程模式进行。
• 3门课程以线下集中课程模式进行。
  [该3门集中线下课程将分配至第一至第三学期，学生每学期只需进行一次面授课程，集中课程约持续一周。]
• 论文写作将在导师指导下独立完成。